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-rw-r--r-- | biology/p5-bioperl-run/Makefile | 445 |
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diff --git a/biology/p5-bioperl-run/Makefile b/biology/p5-bioperl-run/Makefile index 3d733736464a..679c9ca1af79 100644 --- a/biology/p5-bioperl-run/Makefile +++ b/biology/p5-bioperl-run/Makefile @@ -6,362 +6,133 @@ # PORTNAME= bioperl-run -PORTVERSION= 1.4 -PORTREVISION= 1 +PORTVERSION= 1.6.1 CATEGORIES= biology perl5 MASTER_SITES= http://bioperl.org/DIST/ \ CPAN PKGNAMEPREFIX= p5- +DISTNAME= BioPerl-run-${PORTVERSION} MAINTAINER= mauricio@arareko.net COMMENT= Wrapper modules for common bioinformatics tools -BUILD_DEPENDS= p5-bioperl=1.4_2:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \ +BUILD_DEPENDS= p5-bioperl=1.6.0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \ + ${SITE_PERL}/IPC/Run.pm:${PORTSDIR}/devel/p5-IPC-Run \ ${SITE_PERL}/Algorithm/Diff.pm:${PORTSDIR}/devel/p5-Algorithm-Diff RUN_DEPENDS= ${BUILD_DEPENDS} CONFLICTS= p5-bioperl-run-1.[13579]* -PERL_CONFIGURE= YES +PERL_MODBUILD= YES +WRKSRC= ${WRKDIR}/BioPerl-run-1.6.0 -MAN3= Bio::Factory::EMBOSS.3 \ - Bio::Tools::Run::Alignment::Blat.3 \ - Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw.3 \ - 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