/biology/

• ../
• Makefile
• artemis
• avida
• babel
• bamtools
• bcftools
• bedtools
• biococoa
• bowtie
• bowtie2
• bwa
• canu
• cd-hit
• cdbfasta
• checkm
• chemeq
• clustal-omega
• clustalw
• clustalx
• consed
• cytoscape
• ddocent
• diamond
• emboss
• exonerate
• fasta
• fasta3
• fastahack
• fastdnaml
• fastool
• fastqc
• fasttree
• fastx-toolkit
• fluctuate
• freebayes
• garlic
• gatk
• gff2ps
• gmap
• gperiodic
• grappa
• groopm
• hmmer
• htslib
• hyphy
• igv
• infernal
• iolib
• iqtree
• jalview
• jellyfish
• kallisto
• lagan
• lamarc
• libgtextutils
• libsbml
• linux-foldingathome
• mafft
• mapm3
• migrate
• molden
• mopac
• mrbayes
• mummer
• muscle
• ncbi-blast+
• ncbi-cxx-toolkit
• ncbi-toolkit
• ngs-sdk
• njplot
• p5-AcePerl
• p5-Bio-ASN1-EntrezGene
• p5-Bio-Coordinate
• p5-Bio-Das-Lite
• p5-Bio-Das
• p5-Bio-FeatureIO
• p5-Bio-GFF3
• p5-Bio-Glite
• p5-Bio-Graphics
• p5-Bio-MAGETAB
• p5-Bio-NEXUS
• p5-Bio-Phylo
• p5-Bio-SCF
• p5-BioPerl-Run
• p5-BioPerl
• p5-TrimGalore
• p5-transdecoder
• paml
• pbbam
• pbcopper
• pbseqan
• pear-merger
• phrap
• phred
• phylip
• phyml
• plinkseq
• primer3
• protomol
• psi88
• py-Genesis-PyAPI
• py-biom-format
• py-biopython
• py-bx-python
• py-cutadapt
• py-gffutils
• py-gtfparse
• py-loompy
• py-macs2
• py-orange3-bioinformatics
• py-orange3-single-cell
• py-pyfaidx
• py-pysam
• pycogent
• pyfasta
• python-nexus
• rainbow
• recombine
• ruby-bio
• rubygem-bio
• samtools
• seaview
• seqan-apps
• seqan
• seqan1
• seqio
• seqtk
• seqtools
• sim4
• slclust
• smithwaterman
• stacks
• stringtie
• tRNAscan-SE
• t_coffee
• tabixpp
• treepuzzle
• trimadap
• trimmomatic
• ugene
• unanimity
• vcflib
• vcftools
• velvet
• wise
• xmolwt