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path: root/biology/p5-Bio-Phylo/Makefile
blob: 5193815577d5cc8e2a29d15eb7696808b6ef51a7 (plain) (blame)
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# New ports collection makefile for:    Bio-Phylo
# Date created:             12 Mar 2006
# Whom:                 Aaron Dalton <aaron@FreeBSD.org>
#
# $FreeBSD$
#

PORTNAME=   Bio-Phylo
PORTVERSION=    0.16
CATEGORIES= biology perl5
MASTER_SITES=   ${MASTER_SITE_PERL_CPAN}
MASTER_SITE_SUBDIR= Bio
PKGNAMEPREFIX=  p5-

MAINTAINER= aaron@FreeBSD.org
COMMENT=    Phylogenetic analysis using perl

BUILD_DEPENDS=  p5-Exception-Class>1.22:${PORTSDIR}/devel/p5-Exception-Class \
        p5-Math-Random>=0.67:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \
        p5-IO-String>=1.05:${PORTSDIR}/devel/p5-IO-String \
        p5-bioperl>=0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \
        p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG
RUN_DEPENDS=    ${BUILD_DEPENDS}

MAN1=   dndtag.pl.1 \
    droptip.pl.1 \
    bremer.pl.1 \
    age2bl.pl.1 \
    dnd2svg.pl.1
MAN3=   Bio::Phylo.3 \
    Bio::ObjectCompat.3 \
    Bio::Phylo::Adaptor.3 \
    Bio::Phylo::ConfigData.3 \
    Bio::Phylo::Forest.3 \
    Bio::Phylo::Forest::Node.3 \
    Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \
    Bio::Phylo::Generator.3 \
    Bio::Phylo::IO.3 \
    Bio::Phylo::Listable.3 \
    Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum.3 \
    Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Matrix.3 \
    Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node.3 \
    Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree.3 \
    Bio::Phylo::Manual.3 \
    Bio::Phylo::Matrices.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \
    Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \
    Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \
    Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \
    Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \
    Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \
    Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \
    Bio::Phylo::Taxa.3 \
    Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \
    Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \
    Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \
    Bio::Phylo::Treedrawer.3 \
    Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \
    Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \
    Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \
    Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \
    Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \
    Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \
    Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \
    Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \
    Bio::Phylo::Util::XMLWritable.3

PERL_MODBUILD=  5.7.2+

.include <bsd.port.mk>