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# New ports collection makefile for: Bio-Phylo
# Date created: 12 Mar 2006
# Whom: Aaron Dalton <aaron@FreeBSD.org>
#
# $FreeBSD$
#
PORTNAME= Bio-Phylo
PORTVERSION= 0.39
CATEGORIES= biology perl5
MASTER_SITES= CPAN
MASTER_SITE_SUBDIR= CPAN:RVOSA
PKGNAMEPREFIX= p5-
MAINTAINER= perl@FreeBSD.org
COMMENT= Phylogenetic analysis using perl
RUN_DEPENDS= p5-GD>=0:${PORTSDIR}/graphics/p5-GD \
p5-Math-CDF>=0:${PORTSDIR}/math/p5-Math-CDF \
p5-Math-Random>=0:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \
p5-PDF-API2>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-PDF-API2 \
p5-SVG>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG \
p5-SWF-Builder>=0:${PORTSDIR}/graphics/p5-SWF-Builder \
p5-XML-LibXML>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-LibXML \
p5-XML-Twig>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-Twig \
p5-XML-XML2JSON>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-XML2JSON \
p5-bioperl>=0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \
p5-libxml>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-libxml
PERL_CONFIGURE= yes
MAN3= Bio::Phylo.3 \
Bio::Phylo::EvolutionaryModels.3 \
Bio::Phylo::Factory.3 \
Bio::Phylo::Forest.3 \
Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3 \
Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3 \
Bio::Phylo::Forest::Node.3 \
Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \
Bio::Phylo::Generator.3 \
Bio::Phylo::IO.3 \
Bio::Phylo::Identifiable.3 \
Bio::Phylo::Listable.3 \
Bio::Phylo::Manual.3 \
Bio::Phylo::Matrices.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Character.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Characters.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \
Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \
Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \
Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Libxml.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Twig.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Libxml.3 \
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Twig.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Entities.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Meta.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Meta::XMLLiteral.3 \
Bio::Phylo::NeXML::Writable.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Abstract.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Fasta.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Json.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Phylip.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Phyloxml.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Ubiocbmeta.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Ubiometa.3 \
Bio::Phylo::Parsers::Ubiosearch.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Client.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Resource.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Resource::Description.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Service.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Service::Timetree.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Service::Tolweb.3 \
Bio::Phylo::PhyloWS::Service::UbioClassificationBank.3 \
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Bio::Phylo::Set.3 \
Bio::Phylo::Taxa.3 \
Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \
Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \
Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Abstract.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Canvas.3 \
Bio::Phylo::Treedrawer::Gif.3 \
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Bio::Phylo::Treedrawer::Png.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Abstract.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Fasta.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Phylip.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Phyloxml.3 \
Bio::Phylo::Unparsers::Rss1.3 \
Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \
Bio::Phylo::Util::Dependency.3 \
Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \
Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \
Bio::Phylo::Util::Logger.3 \
Bio::Phylo::Util::OptionalInterface.3 \
Bio::Phylo::Util::StackTrace.3
.include <bsd.port.mk>
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